秦都区疾病预防控制中心是由区政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位，隶属于秦都区卫生局位于玉泉路西段。中心设置有主任一名、副主任两名、书记一名，内设办公室，财务室、消杀科、计划免疫科、生物制品科、艾滋病防控科、流行病学科、健康教育科、门诊体检室、检验科，结核病地方病职业病综合防治办公室十一个科室。