病毒病预防控制所是中国疾病预防控制中心下属的独立法人机构。其前身为1949年成立的中央卫生研究院病毒系，后于1964年成立中国预防医学科学院病毒学研究所，原隶属于中国医学科学院。1983年，病毒学研究所划归中国预防医学科学院。2002年1月23日，病毒学研究所正式更名为中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，简称病毒病所。
　　病毒病所是我国唯一的国家级病毒性疾病的预防控制和医学病毒学研究机构。一直秉承“一流的疾控依赖一流的科研，一流的科研促进一流的疾控”的理念，通过前瞻设计和科研攻关具备了强大的科技支撑能力，建有国内最大的高等级生物安全实验室群，形成完善的疾控应急和科学研究体系，圆满完成了我国各类新发突发传染病的应对和防控任务。病毒病所先后产生了中国科学院、中国工程院院士6名；获得国家科技成果奖45项、省部级奖100余项、专利授权和成果转化数百项，新药产品近50个，荣获“国家科技计划执行优秀团队”“埃博拉出血热疫情防控先进集体”“埃博拉出血热疫情防控集体记大功”“2016年中央国家机关先进基层党组织”“2013-2014年度全国青年文明号”以及“五四红旗团支部”等荣誉称号。2017年，侯云德院士荣获国家最高科学技术奖；《以防控人感染H7N9禽流感为代表的新发传染病防治体系重大创新和技术突破》获国家科学技术进步奖特等奖。
　　病毒病所现设有18个专业科室、2个专业管理科室、2个专业学术杂志编辑部和12个职能机构。病毒病所拥有5个世界卫生组织（WHO）参比实验室：WHO流感参比和研究合作中心（发展中国家唯一）、WHO西太区麻疹风疹参比实验室、WHO西太区脊灰参比实验室、WHO西太区乙脑参比实验室、WHO西太区轮状病毒参比实验室。此外还拥有中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所朊病毒检测中心和中国微生物菌毒种（医学病毒）保藏管理中心。