苏州市疾病预防控制中心（以下简称疾控中心）是由苏州市政府举办的、直属于苏州市卫生局领导的、业务上接受江苏省疾病预防控制中心指导的、在辖区内实施疾病预防控制与公共卫生技术服务的行政管理类事业单位。
疾控中心是按照苏州市卫生改革总体目标和有效利用卫生资源的要求，在原苏州市卫生防疫站、苏州市血吸虫病防治站、苏州市皮肤病防治所、苏州市结核病防治所、苏州市健康教育所的基础上，于2001年10月25日组建而成的集疾病预防与控制、卫生检验与卫生学评价、健康教育与促进、应用研究与业务指导、技术管理与服务为一体的卫生防病机构。
疾控中心现坐落于苏州市三香路72号，占地面积10400平方米，工作用房15000平方米，拥有总价值7000余万元的各类卫生检测仪器设备，现有在编人员188人，平均年龄40.5岁，研究生以上学历人员占36％，本科人员占44％，高级专技人员占33％，中级专技人员占36％。
疾控中心设有综合办公室（监察室）、应急（综合业务）办公室、科教人事科、规划财务科、总务设备科、传染病防制科、性病艾滋病防制科、血（吸虫）寄（生虫）地（方病）慢防制科、结核病防治所、食品与学校卫生科、环境卫生科、职业（放射）卫生科、预防医学诊疗部、检验科、质量管理科、信息科、健康教育所、工会．共青团．退管会办公室、预防医学会．防痨协会办公室等科室部门。
疾控中心秉承原各组建单位60余年的优良传统，积极贯彻“预防为主”的工作方针，实施科教兴卫战略，以社会效益为宗旨，坚持质量第一，进行科学管理，开展优质服务，在有关法律、法规和技术标准的框架内，依靠软硬件建设，保证服务和产品质量，实现准确性、有效性和公正性。